貫通式貨架又稱通廊式貨架、駛入式貨架。此系統貨架排布密集，空間利用率及高，幾乎是托盤式貨架的兩倍，但貨物必須是少品種大批量型，貨物先進后出。首先須進行集裝單元化工作，確定托盤的規格、載重量及堆高。由此確定單元貨架的跨度、深度、層間距，根據倉庫屋架下沿的有效高度確定貨架的高度。靠墻區域的貨架總深度最好控制在6個托盤深度以內，中間區域可兩邊進出的貨架區域總深度最好控制在12個托盤深度以內，以提高叉車存取的效率和可靠性（此類貨架系統中，叉車為持續“高舉高打”作業方式，叉車易晃動而撞到貨架）。此類倉儲系統穩定性較弱，貨架不宜過高，通常應控制在10m以內，且為了加強整個貨架系統的穩定性，除規格選型要大一些外，還需加設拉固裝置。單托貨物不宜過大、過重，通常重量控制在1500kg以內，托盤跨度不宜大于1.5m。通常叉車為前移式電瓶叉車或平衡重電瓶叉車。多用于乳品、飲料等食品行業，冷庫中也較為多見。